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如果在注册12306时显示身份证已被注册，可能有以下几种情况。
1、您的身份证可能之前已经被注册过，在这种情况下，可以尝试找回之前注册的账号，或者联系12306客服，寻求他们的帮助来恢复或重置账号。
2、您的身份证信息可能被他人冒用注册，如果发现这种情况，应立即联系12306客服，并提供相关证明文件，如身份证等，以便他们能够调查并解决问题，为了保护个人信息的安全，也需要及时报警并查询是否有其他证件被冒用。
3、输入信息可能有误，在注册时，应确保输入的身份证号码、姓名等信息的准确性，如果有任何输入错误，都可能导致注册失败，可以尝试重新输入正确的信息，再次尝试注册。
如果无法解决问题，建议直接联系12306的客服寻求帮助，他们可以提供针对您具体情况的解决方案，也需要注意保护个人信息的安全，防止个人信息被他人冒用。